MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	TTA	2	6	60	65	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017373	CTA	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017373	TTAG	2	8	3664	3671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017373	GGT	2	6	3694	3699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017373	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017373	T	6	6	6171	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017373	T	6	6	6200	6205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017373	GTAG	2	8	6211	6218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017373	T	6	6	6231	6236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017373	GTTG	2	8	6244	6251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017373	TGT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017373	ACC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017373	CTAA	2	8	7628	7635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017373	TAG	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017373	AGT	2	6	9582	9587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017373	A	6	6	9590	9595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017373	AAAT	2	8	9643	9650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017373	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017373	AAT	2	6	9694	9699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017373	AAT	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017373	GTT	2	6	9730	9735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017373	T	7	7	9734	9740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017373	CAT	2	6	17039	17044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017373	TAA	2	6	17049	17054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017373	A	6	6	17070	17075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017373	A	6	6	17090	17095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017373	A	6	6	17097	17102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017373	T	6	6	17105	17110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017373	A	6	6	17111	17116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017373	ATA	2	6	17146	17151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017373	ACC	2	6	17167	17172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017373	G	6	6	17175	17180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017373	T	8	8	17200	17207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017373	T	7	7	17233	17239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017373	TTTTAA	2	12	17261	17272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017373	AAGA	2	8	17299	17306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017373	TAA	2	6	17307	17312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017373	TAT	2	6	18060	18065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017373	ACC	2	6	18090	18095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017373	CTAA	2	8	18118	18125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017373	TAG	2	6	19943	19948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017373	A	7	7	20056	20062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017373	T	6	6	20066	20071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017373	AT	3	6	22462	22467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017373	TTTAG	2	10	22483	22492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017373	ATT	2	6	22533	22538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017373	A	6	6	23225	23230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017373	TAA	2	6	23232	23237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017373	GAAA	2	8	23269	23276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017373	GATA	2	8	23304	23311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017373	GTAGG	2	10	23339	23348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017373	AAG	2	6	23416	23421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017373	AAAG	2	8	24086	24093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017373	TAT	2	6	24121	24126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017373	T	6	6	24133	24138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017373	AAG	2	6	24141	24146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017373	TCAA	2	8	24177	24184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017373	T	6	6	24186	24191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017373	GTAGG	2	10	24262	24271	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017373	AAG	2	6	24339	24344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017373	T	7	7	25066	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017373	TAGT	2	8	25086	25093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017373	T	6	6	25097	25102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017373	GTTG	2	8	25110	25117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017373	A	6	6	25136	25141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017373	A	6	6	25147	25152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017373	AAC	2	6	25157	25162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017373	TGT	2	6	25449	25454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017373	GC	4	8	25474	25481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017373	CTT	2	6	25564	25569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017373	CTT	2	6	25586	25591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017373	CTT	2	6	25608	25613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017373	CTT	2	6	25630	25635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017373	CTT	2	6	25652	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017373	TG	3	6	25757	25762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017373	GGA	2	6	25809	25814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017373	AG	4	8	25816	25823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017373	AGG	2	6	25836	25841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.